Développeur(se) bioinformaticien(ne) (H/F) en CDD – 6 mois

Description du poste et des missions

Au sein de la Direction Recherche et Innovation, vous êtes en charge du développement de pipelines bioinformatiques et de nouveaux outils dans de nouveaux modules et du transfert dans un environnement compatible avec un usage en clinique.

Vos principales missions sont les suivantes :

• Vous traitez les données afin d’en tirer une information exploitable :

- Analyser et exploiter des données biologiques.

- Modéliser les interactions de fonctions biologiques.

- Analyser des séquences nucléotidiques et peptidiques.

• Vous mettez en œuvre une solution informatique fiable, efficace et adéquate pour répondre à une problématique donnée :

- S’impliquer dans les différents projets de recherche et développement de Transgene.

- Comprendre les problématiques et identifier la solution la plus adaptée pour y répondre.

- Développer dans le langage approprié, un outil permettant d’y répondre.

- Appliquer les bonnes pratiques de validation définies par les référentiels qualité de Transgene.

- Assurer la formation et la maintenance des outils bio-informatiques internes et tiers.

- Communiquer les résultats en interne et en externe pour valoriser le métier et la société.

- Identifier et interagir avec des prestataires externes.

- Collaborer avec une équipe multidisciplinaire (bioinformatique, biostatistique, biologie moléculaire, virologie, clinique, informatique).

• Vous acquerez, organisez et stockez l’information  :

- Gérer l’utilisation de serveurs et base de données externes.

- Assurer le suivi et la maintenance de bases de données bio-informatiques internes.

- Utiliser les outils de fouille de données pour extraire de l’information à partir de sources externes.

- Organiser les données internes pour permettre les méta-analyses

• Vous mettez en place une veille technologique sur les méthodes et les outils :

- Assurer une veille technologique sur les outils de la bio-informatique.

- Assurer une veille technologique concernant les nouvelles plateformes biotechnologiques.

Profil souhaité

Vous possédez au minimum un BAC+3 et avez une double compétence en science de la vie et en informatique.

Vous maîtrisez les langages de programmation bioinformatiques Python et R et informatiques (bash, java, mysql,…).

La maîtrise des bonnes pratiques de programmation et de validation des outils informatiques est également requise.

Vous justifiez également d’une expérience dans le domaine de l’Assurance Qualité et/ou de la Validation.

La maîtrise de l’anglais est indispensable : vous serez amené à l’utiliser pour la lecture de documents et articles scientifiques, la rédaction de résultats, de rapports d’études et de publications d’études scientifiques ainsi que pour des présentations orales.

Lieu de la mission