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Stagiaire en bioinformatique

  • BAC +5
  • Bioinformatique/ Robotique/ Screening
  • Biotechnologies
  • Département : Bas-rhin (67)
  • Type de contrat : Stage
  • Durée : 6 mois
  • Rémunération : Non précisé

Descriptif

Transgene est une société biotechnologique, cotée sur le marché Euronext (Paris), qui conçoit et développe des vaccins thérapeutiques et des produits d’immunothérapie pour le traitement des cancers et des maladies infectieuses.

Transgene met en place actuellement une zone qui a pour vocation la fabrication de petits lots de vaccins thérapeutiques et oncolytiques cliniques de phase 1 et 2. Dans le cadre de la mise en place de cette zone, nous recrutons des Techniciens de Bioproduction (H/F) en CDI sur notre site d’Illkirch (à proximité de Strasbourg).

Formation et expérience :

Vous préparez actuellement une formation de type Bac +5 dans un domaine scientifique (Biosciences, Sciences du Vivant - Bioinformatique ou équivalent…) et recherchez un stage de six mois dans le domaine de la Bioinformatique à compter de début février 2019. Vous disposez de solides connaissances en biologie moléculaire, cellulaire et en analyses de données en grandes dimensions. Vous maitrisez les commandes UNIX, R/Bioconductor et un langage de scripts (Perl, Python, …).

Missions :

Rattaché au Service Bioinformatique, votre sujet de stage portera sur la caractérisation transcriptomique et l’analyse fonctionnelle de génomes de souches de poxvirus à partir de données de séquençage à haut débit (NGS) générées par Transgene, puis appliquées à l’analyse de futures souches vaccinales.

Dans le domaine actuel de l’immunothérapie, l’usage de virus oncolytiques prend une part de plus en plus importante. Parmi eux, certaines souches de poxvirus possèdent des caractéristiques leur permettant de lutter contre certains cancers. Grâce aux données de séquençage à haut débit, de nouvelles souches de virus ont été génétiquement caractérisées et présentent un fort potentiel dans la génération de nouveaux traitements.

Dans le cadre d’un programme de caractérisation fonctionnelle de ces nouvelles souches à visée thérapeutique au sein du département de Recherche et Innovation de Transgene, des données transcriptomiques par séquençage à haut débit (RNA-Seq) ont été générées. L’étude approfondie de l’expression de certains gènes, ainsi que de leurs interactions permettra de mieux comprendre les différences phénotypiques observées. Ces informations pourront servir à la mise au point de nouvelles souches vaccinales thérapeutiques antitumorales.

Vous serez en charge de mettre en œuvre une méthode d’analyse de transcriptomes basée sur des outils existants :

  • Le traitement et l’analyse de données de séquençage haut débit (RNASeq) à partir d’outils tels que Samtools, STAR,…
  • La normalisation et la quantification de données d’expression (R/Bioconductor, DESeq2,…)
  • L’analyse fonctionnelle par la mise en place de réseaux de gènes.

Vous serez amené à effectuer des recherches bibliographiques sur les relations gènes/fonctions.

Profil :

Vous êtes reconnu pour votre sens du travail en équipe, votre rigueur et votre motivation. Vous savez faire preuve d’organisation et appréciez travailler en autonomie. Bonne maîtrise des outils bureautiques, des outils de navigation et de recherche. Bon niveau d’anglais exigé.

Merci de bien vouloir postuer en cliquant sur le lien ci-dessous : 

https://transgene.mycv.tech/offre-fr-eacb5c395167.html

 

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